在水產養殖中，對魚蝦飼料進行發酵處理，可以顯著提高魚蝦的采食量、誘食性，提高魚蝦的健康水平，改善和治療魚蝦腸炎方面的問題，同時降低餌料系數；
同時，我們可以看到，飼喂發酵飼料的魚蝦，水質相對比較穩定，倒藻濃藻水比較少見到，水體理化指標趨于正常，這都是因為發酵飼料中所帶來的提高消化吸收，減少糞便排泄量，以及增加了有益乳酸菌、酵母菌、芽孢桿菌等活菌功能等原因所致；
但在如何使用發酵飼料技術方面，魚蝦與畜牧是有所不同的，最主要的技術控制點，就是不要發酵過度，即適度發酵，適度飼喂，一般有如下幾個方法，具體使用哪種發酵方式，視您的方便情況而定：
1、30%水份短時間發酵并100%飼喂法；
因為高水份發酵的發酵速度快，發酵強度高，所以，只能控制發酵時間，操作方法是：一包水產通用飼料發酵劑 + 魚蝦飼料100～150公斤之間都可以 + 水30～45公斤（飼料量的30%的水），攪拌均勻，然后密封發酵5～24小時（三伏天氣最熱時，只發酵幾小時為宜），并在48小時內喂完，夏天最好24小時內喂完（指100%飼喂的情況下）；
這種100%飼喂的方法，一般只適合于魚蝦幼苗時期，特別是對蝦；因為成魚飼料大多為顆粒飼料，不適合于加水發酵使用；
2、低水份長時間發酵并100%飼喂法；
可以發酵一個月都可以100%飼喂，操作方法是：一包水產通用飼料發酵劑 + 魚蝦飼料100～150公斤 + 水15～22公斤（飼料量的15%的水），攪拌均勻（低水份發酵對攪拌要求高，要求比平常多攪拌一倍的時間），然后嚴格密封（低水份發酵對密封的要求嚴格），進行發酵2天后可以飼喂，并可以保存1～2個月（冬長夏短）；并可以100%飼喂。
同樣地，這種100%飼喂的方法，一般只適合于魚蝦幼苗時期；
3、高水份長時間發酵但摻著喂的方法
高水份長時間發酵，但只能摻著喂的方法，但只是摻著喂的方法：操作方法是：一包水產通用飼料發酵劑 + 魚蝦飼料100～150公斤之間都可以 + 水40～60公斤（飼料量的40%或以上的水），攪拌均勻，然后密封發酵3天以上，同時，嚴格密封保存，可以保存一年以上；
這種高水份發酵的方法，一般以10%左右添加于未發酵的魚蝦飼料中，也適合于飼喂顆粒飼料或浮性顆粒飼料中，可以將發酵料粉料與顆粒飼料混合均勻，讓其粘在顆粒飼料表面即可飼喂。
在對蝦養殖中，對蝦養殖前期占總飼料量的30%，與未發酵的對蝦飼料混合均勻后飼喂，對蝦養殖后期占總飼料喂量的10%，與未發酵的對蝦飼料混合均勻后飼喂，攪拌均勻后直接飼喂。
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4、發酵魚蝦飼料，與直接在飼料中添加乳酸菌產品有何區別？
以對蝦為例：那么發酵的對蝦飼料，與在飼料中添加強微蝦偷樂和強微水產苷有什么區別呢？
用水產通用飼料發酵劑來發酵對蝦飼料的優點是乳酸菌含量高，誘食性好，活力強，效果好，用了發酵對蝦飼料的，就不必另外在飼料添加強微蝦偷樂和強微水產苷了，且效果比強微蝦偷樂好，對蝦的殼硬，有利于幫助換殼（當然，前提條件是水中的活性鈣含量要足，總堿度要足），同時，發酵后的適口性非常好，并好于添加強微蝦偷樂；
5、為什么魚蝦發酵飼料不能發酵過度？（養殖前期除外）
魚蝦養殖的前期，發酵過度的飼料影響倒也不大，甚至可以用水產發酵劑發酵保存10天都仍可以100%飼喂；這是因為前期有吃料量極小，甚至魚蝦幾乎是以發酵料培育的天然餌料（浮游動物和藻類）為主食，所以，魚蝦養殖前期，即使發酵過度，對腸道的影響或副作用都不會顯現，況且前期以預防疾病為主，抑制腸道內弧菌為主要目的，所以，允許超量使用，允許發酵透徹（過度）使用都可以；
后期則一定要按以上規定來操作，即魚蝦養殖后期不得發酵過度。
因為后期的吃料量顯著增加，如果采食過度發酵的對蝦飼料（發酵過度則酸度過高，以及乳酸菌量太大），后期對蝦的吃料量又大，可能造成腸道的菌群太過于單一，腸黏膜被酸化過度，造成腸壁變薄，腸管變細，甚至出現空腸空胃（主要是脫節）的現象；所以，后期不建議過度發酵。
例如對蝦在40天后的后期，即使不發酵飼料，而是直接添加強微蝦偷樂于飼料中，也不要超量，就按規定的每公斤飼料0.6克來添加使用，添加時如果加水20%使用的，也不要放置太久或說發酵太久，只幾小時就要喂完為宜。超量使用強微蝦偷樂乳酸菌，一樣存在以上副作用的；
最后，①采用發酵魚蝦飼料；②或采用魚蝦飼料中添加乳酸菌制劑的；是二選一，用了發酵的方式的，就不要在飼料中添加強微蝦偷樂了；或在飼料添加了強微蝦偷樂的就不要再發酵魚蝦飼料了；
發酵對蝦飼料采用水產通用飼料發酵劑，效果上比直接添加強微蝦偷樂更好，但也更為麻煩，麻煩的東西總是更好的，通用飼料發酵劑發酵對蝦飼料更好體現在：適口性或采食量更加好，二是幫助硬殼和換殼，殼更硬朗。
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